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Le Visium CytAssist est un instrument de paillasse compact qui permet le transfert de sondes transcriptomiques de lames de verre standard vers des lames Visium, permettant ainsi d'obtenir des informations de profilage spatial à partir d'encore plus d'échantillons. Compatible avec l'hématoxyline et l'éosine (H&E) ou l'immunofluorescence (IF) -coupes de tissus colorées, CytAssist permet d'utiliser des tissus pré-coupés pour le flux de travail Visium. Vous pouvez optimiser davantage vos expériences Visium en criblant des coupes de tissus à l'aide de techniques histologiques standard pour trouver des coupes biologiquement significatives, puis en alignant avec précision ces coupes dans la zone de capture de lames Visium à l'aide de CytAssist.
Visium CytAssist vous permet de commencer votre expérience de profilage spatial en sectionnant vos tissus sur une lame de verre standard. Tout comme votre flux de travail histologique typique, vous pouvez ensuite déparaffiner, colorer (H&E ou IF) et imager les coupes. Lorsque vous êtes prêt à commencer le profilage spatial, les sections sont déliées et hybridées avec des sondes transcriptomiques pour informer de la présence d'un ARN cible. Après l'hybridation des sondes, Visium CytAssist facilite le transfert de ces sondes transcriptomiques de la lame de verre vers une zone de capture sur la lame Visium. Dans l'instrument, deux lames de verre standard et une lame Visium à deux zones de capture sont placées de manière à ce que les sections de tissus sur les lames de verre soient alignées au-dessus des deux zones de capture Visium. Vous pouvez ensuite passer aux étapes restantes du flux de travail Visium pour découvrir les modèles d'expression génique dans les coupes de tissus.